漫长的地质年代，沧海桑田，距今约200万年前，地球的造山运动使岷山山脉伴随着青藏高原一同快速隆起，黄龙沟也在这期间形成典型的冰川U形谷地。该区属古生界和三叠系以碳酸盐为主的地层，地质结构复杂。黄龙古寺南侧的望乡台断裂带是重要的地下水通道，富含碳酸氢钙的地下水通过深部循环，在此出露形成转花泉群，并成为黄龙钙华堆积的源泉。这些水流经黄龙沟凸凹不平的河床，造成水流变化，加上树根、落叶局部阻塞以及“生物喀斯特”作用，在温度、压力、水动力等因素变化的影响下，水中的碳酸钙沉积下来，形成钙华塌陷、钙华滩流、钙华瀑布等独特的露天喀斯特堆积地貌景观。这种高山、高寒环境下形成的大规模钙华堆积地貌，是世界上绝无仅有的景观。

喀斯特地貌

　　喀斯特(Karst)，原为欧洲巴尔干半岛的一个地名，那里是石灰岩分布区，因石灰岩的溶蚀和浸蚀形成各种奇特的地形。后来，科学家们便借用“喀斯特”一词来称呼因岩石的化学溶解而引起的一系列地质作用和地貌现象。因石灰岩被溶蚀和再沉积而形成的各种地貌，被称为喀斯特地貌。

边石坝彩池

　　边石坝彩池是黄龙露天钙华堆积的一种主要形式。它是钙华体表面波痕状或鱼鳞状凹坑，经扩大、合并、生长而形成的。钙华池层层叠叠逶迤而下，状若梯田，池水如碧如玉。五彩斑斓。黄龙是迄今为止世界上发现数量最多、规模最大的边石坝彩池景观。

生物喀斯特

　　黄龙钙华堆积地貌的形成和水生植物有密切关系，科学家们称之为“生物喀斯特作用”。其原理主要由两方面组成：一是“光合作用”，白天，水生植物吸入水中的二氧化碳，产生氧气，使钙华沉积；二是“呼吸作用”，夜晚，水生植物吸入水中的氧气，产生二氧化碳，使钙华溶解。是否出现钙华沉积，则要看净光合作用(总光合作用—总呼吸作用)的大小。据实验，只有在一定低温(低于20c)范围内。净光合作用才会达到最大值。由于黄龙地处高寒山区，在具备充足的钙华沉积物源的基础上。低温的环境和良好的植被，便成为促进地表大量钙华堆积的主因。在黄龙沟的彩池、滩流和瀑布中。常常可以看到围绕和依附植物茎干和枝叶形成的钙华，这是生物喀斯特作用促进钙华沉积的典型例证。